2020年8同年11日，来自荷兰乌得勒医学院的傅靖远教授小两组在Nature Communications上公开发表题为Gut microbial co-abundance networks show specificity in inflammatory bowel disease and obesity的篇文章。
消化道有机体群是一个就其复杂相互主导作用的生态平衡。现有，研究者技术人员对消化道有机体群在卫生和癌症之中的主导作用的明了主要缺少不尽相同的有机体总质量，而对有机体相互主导作用在人类文明癌症故事情节下的主导作用相吻合。在这里，研究者技术人员使用来自四个人类文明函数调用的2379个元基因框架并非常了有机体共约总质量互联网：一个黏膜性肠病(IBD)函数调用，一个心血管癌症函数调用和两个基于人群的函数调用。研究者技术人员见到，38.6%的鸟类共约总质量和64.3%的移动式共约总质量的准确度在函数调用中间假定除此以外关联性，113个鸟类和1，050个移动式共约总质量结果显示借助于IBD抗体效应，281个移动式共约总质量结果显示心血管癌症抗体效应。研究者技术人员也可以在整合人类文明有机体两组(iHMP-IBD)项目的IBD函数调用的主干资料之中解码这些IBD有机体共约总质量。研究者技术人员的研究者明确了IBD和心血管癌症的几个极为重要鸟类和移动式，并提供了证据说明癌症之中有机体总质量的改变可以影响它们的共约总质量间的关系，这独特了研究者技术人员现有对癌症之中有机体失调的了解。
消化道有机体共约总质量互联网的框架
研究者结果显示，有机体两组合成和机能图谱在更大素质上是重叠的，尽管研究者技术人员通过观察到IBD函数调用之中的鸟类两组合成再次发生了除此以外变化。至少一个函数调用之中>20%的样本之中假定的134个细碎裂虫各种类型和343个有机体移动式被纳入有机体互联网推断。研究者技术人员结合SparCC和SpiecEasi方式建立了有机体共约总质量间的关系。
对于鸟类互联网，研究者技术人员在LLD函数调用之中明确了2604个共约同总质量，在500FG函数调用之中明确了1591个共约同总质量，在300OB函数调用之中明确了1107个共约同总质量，在IBD函数调用之中明确了2554个共约同总质量，总共约造成了3454个独特的鸟类共约同总质量。值得一提的是的是，82.1%的鸟类共约同总质量也展现借助于共约现。
对于移动式，共约总质量的比例从500FG的37，279个到LLD的40，699个都为，总共约造成了43，355个独特的移动式共约总质量。
不尽相同的有机体共约同总质量说明了在总质量技术水平上
当可视就其如前所述共约总质量的100个鸟类和304条移动式时，76%的鸟类和84%的移动式在函数调用中间的总质量技术水平也结果显示借助于除此以外关联性。这意味着如前所述的共约总质量间的关系在更大素质上说明了在不尽相同的有机体总质量上。研究者技术人员总结了来自同一归入或来自不尽相同归入的鸟类中间关联性共约总质量的比例。共约总质量异质性最大的归入是碎裂虫株，不仅在不尽相同的碎裂虫株中间通过观察到大量不尽相同的共约总质量，而且在碎裂虫株与其他归入的鸟类中间也通过观察到大量不尽相同的共约总质量，如真细碎裂虫和韦洛氏碎裂虫。在IBD函数调用之中，碎裂虫株的各种类型更高，这与之前的研究者结果一致。对移动式共约总质量也见到了近似于的通过观察，尤其是多肽多肽移动式，它不仅在自身内部，而且在与嘧啶和胺基酸多肽就其的各种移动式方面也结果显示借助于多样性。
特定的有机体共约总质量在癌症函数调用之中钼
研究者技术人员研究者了如前所述的共约同总质量间的关系否由特定的函数调用飞轮，即一个函数调用之中的函数调用总质量准确度否与其他三个函数调用之中的函数调用总质量准确度有更大不尽相同。有趣的是，与基于群体的函数调用相比较，癌症函数调用之中的群两组抗体共约总质量除此以外钼：113(94%)个鸟类共约总质量和1050个(72%)移动式共约总质量与IBD函数调用特异就其，281个(19.4%)移动式共约总质量与300OB函数调用特异就其，正因如此，只有3个鸟类和117条移动式的共约同总质量间的关系专归入于基于生态平衡的函数调用LLD和500FG。研究者技术人员的结果凸显了有机体的共约同总质量取决于宿主的卫生和癌症情况。
IBD之中的有机体共约总质量互联网
在整合人类文明有机体两组项目(iHMP-IBD)函数调用之中解码IBD互联网：在研究者技术人员的IBD函数调用之中建立的2554个鸟类和37，699个移动式共约总质量之中，研究者技术人员能够审计iHMP-IBD39之中77个IBD母体之中的2090个鸟类共约总质量和37，106个移动式共约总质量。鸟类共约同总质量的相非常较低解码率在更大素质上是一个负载问题，因为研究者技术人员还通过观察到，1705(81.6%)个鸟类共约同总质量和24，165个(65.1%)移动式共约同总质量在研究者技术人员的IBD函数调用和iHMP-IBD函数调用中间的共约同总质量准确度没有人除此以外关联性。然后，研究者技术人员非常了iHMP-IBD函数调用第一个和终于一个小时点(相隔~1年)中间的IBD互联网，解码了90.6%的鸟类共约总质量和99.6%的移动式共约总质量。这说明，研究者技术人员对IBD共约总质量准确度的估算在不尽相同的函数调用之中更大素质上是可重复的，并且随着小时的很短是稳定的。
IBD的有机体互联网与癌症形态的间的关系：之前的研究者说明，通过观察到的有机体总质量关联性可以用IBD14的某些癌症形态来解释。因此，研究者技术人员推论同源总质量间的关系也可能是这种情况。研究者技术人员审计IBD共约总质量否与癌症HIV-[溃疡性结肠炎(UC，n=189)与克罗恩病(CD，n=276)]、癌症部位[回肠(n=212)与结肠(n=286)]以及癌症商业活动[黏膜(n=121)与非黏膜(n=377)]就其。大多数共约总质量间的关系在癌症形态中间是可比的，只有少数在FDR
与制剂就其的IBD有机体互联网：研究者技术人员进一步飞行测试了制剂使用否才会影响有机体共约总质量，因为IBD病症使用类固醇(20.0%)和质子泵胺(PPI；26.5%)高于比如说人群函数调用(1.1%和8.4%)。研究者技术人员见到类固醇浏览和非类固醇浏览中间的鸟类共约总质量没有人除此以外关联性，而在37，959(3.7%)条移动式共约总质量间的关系之中，有1049条(3.7%)的移动式共约总质量间的关系在PPI浏览和非浏览中间结果显示借助于统计上的除此以外关联性，尤其是与多肽多肽和甲基赤藓糖类醇羟基移动式有关。
IBD之中的极为重要鸟类和移动式：当将IBD之中的有机体共约总质量与其他3个函数调用展开非常时，研究者技术人员明确了113个鸟类共约总质量和1050个路径共约总质量，与其他3个函数调用相比较结果显示借助于除此以外不尽相同的影响。然后，研究者技术人员审计这些IBD抗体共约总质量否与可能与癌症就其的特定移动式或鸟类持续性就其24，研究者技术人员的研究者明确了IBD的三个极为重要鸟类和四个极为重要移动式。
重点碎裂虫种为病原体、产状草杆碎裂虫和怀特文尼茨放线碎裂虫。病原体和产甲氧碎裂虫当初曾与IBD14，41-45就其。有趣的是，病原体与具有促炎物理性质的鸟类(如碎裂碎裂虫株)结果显示借助于正的共约总质量间的关系，而与具有抗炎物理性质的鸟类(如普氏镰刀碎裂虫)结果显示借助于负的共约总质量间的关系。
IBD的极为重要移动式包含C1化合物借助于和汉民族移动式、两条维生素多肽移动式和多肽多肽移动式。IBD之中最极为重要的机能移动式是碱性TCA可逆移动式(P23-pwy)，它有76个IBD抗体共约总质量，其之中94.7%在iHMP-IBD函数调用之中解码。碱性TCA可逆是一条二氧化碳固定移动式，已被认为是生产用于糖类、啮、多肽、嘧啶和菜醌多肽的有机分子的独有移动式。
尽管IBD之中这一移动式的总质量较高，但IBD之中这一移动式的共约总质量间的关系(r=0.1)弱于其他函数调用(r=0.3)。研究者技术人员见到IBD病症之中18.8%的菜醌多肽移动式是由病原体贡献的，是两个人群函数调用的2倍。这一见到说明，病原体是IBD之中菜醌多肽的重要资源库，这可能才会促进其他有机体的生长。事实上，研究者技术人员的研究者还阐明了病原体是IBD的极为重要鸟类，与15个鸟类展现借助于IBD特有的共约总质量间的关系。其之中，与黏膜就其的碎裂虫株各种类型有要强的正不明确性，包含碎裂碎裂虫株、外周碎裂虫株和婴孩碎裂虫株。因此，与其他函数调用相比较，IBD病症的菜醌多肽与碎裂虫株各种类型中间的不明确性更高。
300OB之中的有机体共约总质量互联网
300OB互联网在LLD心血管癌症母体之中的解码：在300OB函数调用之中检测到1107个鸟类和37，886个移动式共约总质量。这些估算的共约总质量准确度在LLD函数调用之中年龄组和体形指数(BMI)匹配的134名心血管癌症者之中大部分可解码，991(89.5%)种共约总质量和32，963(87.0%)移动式共约总质量结果显示没有人关联性。
与心血管癌症就其癌症就其的有机体互联网：300OB函数调用是为了研究者心血管癌症个人的心血管癌症而所设的，其之中包含139名静脉粥样增生深褐色病症和159名心血管癌症对照。此外，35名300OB参与者患有糖类尿病。在这里，研究者技术人员只通过观察到三种与心血管癌症就其的鸟类共约总质量，所有这三种鸟类在有深褐色的病症之中都结果显示借助于比没有人深褐色的病症更强的共约总质量。
心血管癌症的极为重要移动式：当研究者技术人员非常300OB和其他3个函数调用之中的有机体共约总质量时，研究者技术人员明确了281个移动式共约总质量，它们结果显示借助于除此以外不尽相同的影响，即心血管癌症抗体共约总质量。心血管癌症的一个极为重要移动式是尿囊素的水解，它结果显示了85条移动式的心血管癌症抗体共约总质量间的关系。尿囊素是多种植物(如山药)之中的活性成份之一，被见到具有促进本品分泌和降低浓度的主导作用。其水解游离草酸在苹果酸亚胺/糖类类多肽之中起抑制主导作用。与此相符合，研究者技术人员见到尿囊素水解移动式与苹果酸/糖类类(包含赖氨酸、高丝氨酸、蛋氨酸、糖类和异亮氨酸)的多肽移动式和糖类类的多肽移动式呈过强的负就其，两者皆与空腹浓度技术水平呈正就其，与空腹本品技术水平呈负就其。
独有借助于处：
Lianmin Chen, Valerie Collij, Martin Jaeger, et al.Gut microbial co-abundance networks show specificity in inflammatory bowel disease and obesity.Nat Commun. 2020 Aug 11;11(1):4018. doi: 10.1038/s41467-020-17840-y.
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