Sci Rep:5-miRNA标签特征可作为食管鳞状细胞癌的肾功能生物标志物

2021-11-22 04:11:51 来源:
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这项研究课题宗旨确定一种可以数据分析腹腔鳞状细胞癌(ESCC)患者总体增重(OS)的miRNAs标签。

从NCBI GEO获得119名ESCC患者的miRNA表达著者及其具体来说的临床电子邮件,并将其作为受训集。在晚期和更早检验间筛选差异表达的miRNAs(DEmiRNAs)。用到Cox回归深入研究课题、数组相似性消除(RFE)-支持分量机(SVM)算法和LASSO Cox回归静态来识别病症性miRNAs,从而建立病症评分静态。此外,数据分析了这些病症性miRNAs的有前途靶基因序列,然后构建了miRNA靶基因序列网络。通过特性富集深入研究课题,深入研究课题了ESCC中这些病症性miRNAs数据分析靶基因序列的特性特别性。

在受训分散,晚期与更早检验有46个DEmiRNAs。建立了基于5个miRNAs的后果评分静态。该5-miRNA后果评分可以将受训集分为OS星期明显不尽相同的高危组和低危组。在一个来自癌症基因序列组概要(TCGA)的分立数据分散,最终的测试了5-miRNA后果评分的后果分层能力。已确定了与这些miRNAs特别的各种生物学过程和路中,例如Wnt信号路中、TRP通道的炎症介质调节路中和激素信号路中。

这项研究课题提示,与病理分段特别的5-miRNA标签对数据分析ESCC患者的病症不具备临床意义。

更早出处:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

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